L'avantage de la plate-forme Shopify est que Shopify a ouvertement déclaré qu'ils ne cherchaient pas à résoudre tous les problèmes pour leurs marchands. Au lieu de cela, ils ont créé leurs API et App Store afin que les développeurs indépendants puissent créer (et facturer) les fonctionnalités souhaitées par leurs marchands. Cela signifie qu'il est possible d'étendre et de personnaliser Shopify à l'aide d'applications Shopify, que vous souhaitiez améliorer votre propre magasin Shopify ou créer une application Shopify en tant qu'entreprise. Les applications Shopify ne doivent pas non plus être complexes. Une application Shopify est simplement un logiciel qui s'intègre aux API REST de Shopify. Shopify met à disposition des outils et des kits de développement logiciel (SDK) pour faciliter la création d’une application, mais tout programme peut devenir une application Shopify avec un peu d’intégration.